В юности Екатерина Кукса играла в футзал на любительском уровне. Там её заметили тренеры «Атекса», и именно в этом клубе полузащитница начала профессиональную карьеру. Затем она выступала за «Инвиктус» и «Колос» в Первой лиге, с которым завоевала чемпионский титул.

В 2022 году Кукса перешла в киевское «Динамо», где провела два сезона, после чего стала игроком «Оболони». Екатерина вызывалась в молодёжную сборную Украины U19. На поле она хорошо оценивает пространство и выполняет большой объём работы как при владении мячом, так и без него.